V léčbě migrény rozlišujeme:
1) "Akutní léčbu" tj. léky na ztlumení nebo zastavení již vzniklého záchvatu a
2) léky preventivní.
Akutní léčba migrény zaznamenala v posledních letech výrazný pokrok. Ten souvisí s výsledky výzkumů, popsaných v oddíle "Co způsobuje migrénu?". Výsledkem tohoto poznání podstaty migrénového záchvatu jsou léky, které jsou přímo schopny jej zastavit či ukončit. Tyto látky se nazývají "triptany". Tím, že působí na samotnou podstatu migrénového záchvatu a nikoli jenom na ztlumení jeho následků (tj. bolesti z vzniklého zánětu), jsou tyto "triptany" u migrény mnohem účinnější než klasické léky proti bolesti.
Nicméně než zahájíme léčbu, je potřeba zjistit, zda jde skutečně o migrénu. V praxi se totiž někdy setkáváme s případy, kdy pacienti označují každou bolest hlavy jako migrénu. Často také bývá migréna kombinována s tenzními bolestmi hlavy. Odlišit tyto dva druhy bolesti je důležité, protože léčba "triptany"je velmi účinná právě pro migrénu, ale u obvykle podstatně slabších tenzních bolestí, které mají i jiný mechanismus, není vhodná a ani účinná. K odlišení bolestí hlavy různého typu může pomoci pacientům tzv. migrenózní kalendář.